使用机器学习算法来预测复杂系统的行为正在蓬勃发展。但是,在包括燃烧在内的多物理问题中有效利用机器学习工具的关键是将它们与物理和计算机模型搭配使用。如果所有先验知识和物理约束都体现了这些工具的性能。换句话说,必须对科学方法进行调整,以使机器学习进入图片,并充分利用我们生成的大量数据,这要归功于数值计算的进步。本章回顾了一些开放的机会,用于应用燃烧系统的数据驱动的减少订单建模。提供了湍流燃烧数据,经验低维歧管(ELDM)识别,分类,回归和降低阶数模型中特征提取的示例。
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在许多反应流系统中,已知或假定热化学状态空间与低维歧管(LDM)相近。可以使用各种方法来获取这些歧管,并随后表达具有更少参数化变量的原始高维空间。主成分分析(PCA)是可用于获得LDM的维度降低方法之一。 PCA没有对参数化变量做出事先假设,并从训练数据中凭经验检索它们。在本文中,我们表明将PCA应用于局部数据簇(本地PCA)能够检测热化学状态空间的内在参数化。我们首先证明,使用三种不同复杂性的共同燃烧模型:Burke-Schumann模型,化学平衡模型和均匀反应器。这些模型的参数化已知先验,可以通过本地PCA方法进行基准测试。我们进一步将本地PCA的应用扩展到更具挑战性的案例,即湍流的非原型$ n $ heptane/air喷气火焰,该燃料不再显而易见。我们的结果表明,对于更复杂的数据集也可以获得有意义的参数化。我们表明,局部PCA找到可以链接到局部化学计量,反应进度和烟灰形成过程的变量。
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In a recent paper Wunderlich and Pehle introduced the EventProp algorithm that enables training spiking neural networks by gradient descent on exact gradients. In this paper we present extensions of EventProp to support a wider class of loss functions and an implementation in the GPU enhanced neuronal networks framework which exploits sparsity. The GPU acceleration allows us to test EventProp extensively on more challenging learning benchmarks. We find that EventProp performs well on some tasks but for others there are issues where learning is slow or fails entirely. Here, we analyse these issues in detail and discover that they relate to the use of the exact gradient of the loss function, which by its nature does not provide information about loss changes due to spike creation or spike deletion. Depending on the details of the task and loss function, descending the exact gradient with EventProp can lead to the deletion of important spikes and so to an inadvertent increase of the loss and decrease of classification accuracy and hence a failure to learn. In other situations the lack of knowledge about the benefits of creating additional spikes can lead to a lack of gradient flow into earlier layers, slowing down learning. We eventually present a first glimpse of a solution to these problems in the form of `loss shaping', where we introduce a suitable weighting function into an integral loss to increase gradient flow from the output layer towards earlier layers.
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Artificial intelligence methods including deep neural networks (DNN) can provide rapid molecular classification of tumors from routine histology with accuracy that matches or exceeds human pathologists. Discerning how neural networks make their predictions remains a significant challenge, but explainability tools help provide insights into what models have learned when corresponding histologic features are poorly defined. Here, we present a method for improving explainability of DNN models using synthetic histology generated by a conditional generative adversarial network (cGAN). We show that cGANs generate high-quality synthetic histology images that can be leveraged for explaining DNN models trained to classify molecularly-subtyped tumors, exposing histologic features associated with molecular state. Fine-tuning synthetic histology through class and layer blending illustrates nuanced morphologic differences between tumor subtypes. Finally, we demonstrate the use of synthetic histology for augmenting pathologist-in-training education, showing that these intuitive visualizations can reinforce and improve understanding of histologic manifestations of tumor biology.
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机器学习,特别是深度学习方法在许多模式识别和数据处理问题,游戏玩法中都优于人类的能力,现在在科学发现中也起着越来越重要的作用。机器学习在分子科学中的关键应用是通过使用密度函数理论,耦合群或其他量子化学方法获得的电子schr \“ odinger方程的Ab-Initio溶液中的势能表面或力场。我们回顾了一种最新和互补的方法:使用机器学习来辅助从第一原理中直接解决量子化学问题。具体来说,我们专注于使用神经网络ANSATZ功能的量子蒙特卡洛(QMC)方法,以解决电子SCHR \ “ Odinger方程在第一和第二量化中,计算场和激发态,并概括多个核构型。与现有的量子化学方法相比,这些新的深QMC方法具有以相对适度的计算成本生成高度准确的Schr \“ Odinger方程的溶液。
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抽象推理是智能系统的关键能力。大型语言模型在抽象推理任务上实现了高度的性能,但表现出许多缺陷。但是,人类的抽象推理也是不完美的,并且取决于我们对推理问题内容的知识和信念。例如,人类对在日常情况下基于逻辑规则的逻辑规则比关于抽象属性的任意规则更可靠地理解。语言模型的培训经验类似地赋予了他们先前的期望,这些期望反映了人类的知识和信念。因此,我们假设语言模型会显示出类似人类的内容对抽象推理问题的影响。我们在三个逻辑推理任务中探讨了这一假设:自然语言推论,判断三段论的逻辑有效性和ison选择任务(Wason,1968)。我们发现,最新的大语言模型(具有7或700亿个参数; Hoffman等,2022)反映了这些任务中人类在人类中观察到的许多相同模式 - 像人类一样,模型对可信情况的理由更有效地理由不现实或抽象的。我们的发现对理解这些认知效应以及有助于语言模型表现的因素具有影响。
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对RAS和RAF蛋白的行为与细胞膜中局部脂质环境之间关系之间的关系的了解对了解癌症形成的基础机制至关重要。在这项工作中,我们采用深度学习(DL)来学习这种关系,通过预测基于脂质膜的RAS和RAS-RAF蛋白复合物的蛋白质定位状态,该状态基于蛋白质结构域周围的脂质密度(CG),相对于脂质膜。分子动力学(MD)模拟。我们的DL模型可以预测六个蛋白质状态,总体准确性超过80%。这项工作的发现为蛋白质如何调节脂质环境提供了新的见解,这反过来又可以帮助设计新型疗法以调节与癌症发展相关的机制中的这种相互作用。
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静电执行器为创建软机器人板提供了一种有希望的方法,因为它们的柔性外形,模块化集成和快速响应速度。但是,它们的控制需要千伏信号,并理解由板上和环境效应的力相互作用引起的复杂动力学。在这项工作中,我们演示了一个不受限制的二维五实机压电机器人,该机器人由电池和板载高压电路提供动力,并通过无线链路进行控制。可扩展的制造方法基于彼此之间的键合化层(钢箔底物,执行器,柔性电子设备)。机器人表现出一系列可控运动,包括双向爬行(高达〜0.6 cm/s),转弯和现场旋转(约1度/s)。高速视频和控制实验表明,运动的丰富性是由于机器人中不对称质量分布的相互作用以及动力学对压电驱动频率的相关依赖性。
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非对比度CT(NCCT)图像中准确的梗塞分割是迈向计算机辅助急性缺血性中风(AIS)评估的关键步骤。在临床实践中,脑半球的双侧对称比较通常用于定位病理异常。最近的研究探索了不对称的协助AIS分割。但是,在评估其对AIS的贡献时,大多数以前基于对称性的工作都混合了不同类型的不对称性。在本文中,我们提出了一个新型的不对称分解网络(ADN),以自动将NCCT中的病理不对称性和内在的解剖不对称分离,以进行更有效和可解释的AIS分割。 ADN首先基于输入NCCT进行不对称分解,该输入nccts产生不同类型的3D不对称图。然后生成合成的,固有的 - 敏化补偿和病理 - 空气 - 对称盐的NCCT体积,后来用作分割网络的输入。 ADN的培训结合了领域知识,并采用了组织型意识到的正则化损失函数,以鼓励临床上敏感的病理不对称提取。加上无监督的3D转换网络,ADN在公共NCCT数据集上实现了最新的AIS分割性能。除了出色的表现外,我们认为学到的临床可解剖的不对称图也可以为更好地理解AIS评估提供见解。我们的代码可从https://github.com/nihaomiao/miccai22_adn获得。
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归纳逻辑推理是图上的基本任务之一,该任务旨在从数据中概括模式。已经针对传统图形数据集(例如知识图(KG))进行了广泛研究此任务,并具有代表性的技术,例如归纳逻辑编程(ILP)。现有的ILP方法通常假设从具有静态事实和二进制关系的KG学习。除KGS外,图形结构在其他应用程序中广泛存在,例如视频说明,场景图和程序执行。虽然感应性逻辑推理对这些应用也有益,但将ILP应用于相应的图是非平凡的:它们比KGS更复杂,KG通常涉及时间戳和N-元素关系,实际上是一种具有时间事件的超透明的类型。在这项工作中,我们研究了两个这样的应用,并建议用时间间隔代表它们为超图。为了在此图上进行推理,我们提出了遍历此超图的多启动随机B-Walk。将其与路径矛盾算法相结合,我们提出了一种有效的向后链接ILP方法,该方法通过从时间和关系数据中概括来学习逻辑规则。
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